233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3394 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 392 aa  795    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  62.7 
 
 		 387 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  62.17 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  60.95 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  58.06 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  58.71 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  54.5 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  54.22 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  58.24 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  55.19 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  54.07 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  57.3 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  57.03 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  54.05 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  50.65 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  52.99 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  53.44 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  52.27 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  54.13 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  54.26 
 
 		 395 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  51.06 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  51.9 
 
 		 397 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  50 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  51.37 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  52.21 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  49.45 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  48.64 
 
 		 395 aa  311  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  43.95 
 
 		 404 aa  299  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  49.27 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  49.22 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  43.94 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  42.13 
 
 		 372 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  45.55 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  43.16 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  43.84 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  43.92 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  44.93 
 
 		 371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  42.82 
 
 		 358 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  44.02 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  41.58 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  47.57 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  43.84 
 
 		 358 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  44.12 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  41.13 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  36.91 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  43.52 
 
 		 374 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  43.52 
 
 		 374 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  41.08 
 
 		 360 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  43.52 
 
 		 374 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  41.71 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  43 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  43.41 
 
 		 365 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.08 
 
 		 377 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  41.49 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  41.49 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  39.29 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  39.14 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  36.73 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  43.04 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  39.56 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  43.04 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  41.49 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  41.44 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  43.04 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.46 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  36.74 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  41.47 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  36.46 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  40.87 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  40.87 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  38.98 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  40.87 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  42.44 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  37.89 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  42.44 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  40.87 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  40.87 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  41.54 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  41.69 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  39.54 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  39.54 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  41.28 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  40.87 
 
 		 375 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  40.67 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  42.07 
 
 		 367 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  38.98 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  41.54 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  38.96 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  40.06 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  40.76 
 
 		 364 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  42.62 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  38.81 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  40.72 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  39.76 
 
 		 370 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  39.31 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  38.04 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  36.71 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>