237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1844 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  939    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0173985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.08 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  45.88 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  44.59 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  43.74 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.52 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  44.76 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  42.94 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  43.78 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  41.94 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  42.17 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.14 
 
 		 536 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  42.09 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  43.15 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.88 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  43.35 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  44.37 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  42.49 
 
 		 500 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.22 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.89 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  42.34 
 
 		 500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  41.52 
 
 		 500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.89 
 
 		 500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  41.67 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  43.7 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.57 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  45.09 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  40.04 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.45 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  41.67 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.35 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.75 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  44.06 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  41.24 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  39.19 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.25 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.67 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  42.73 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.31 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.29 
 
 		 536 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  39.33 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  39 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  39 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  39.33 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  39.33 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  39.29 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  39.87 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  41.33 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.04 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  41.4 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.9 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  43.52 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  41.45 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.4 
 
 		 509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  40.49 
 
 		 508 aa  338  9e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.69 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  39 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.74 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  44.54 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.66 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  39.71 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  43.14 
 
 		 504 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  42.12 
 
 		 499 aa  335  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  41.89 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.4 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.49 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  40.59 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  42.77 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  42 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  39.91 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  42.48 
 
 		 503 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  42.7 
 
 		 500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  41.84 
 
 		 505 aa  329  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  41.54 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  41.76 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  40.79 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  40.65 
 
 		 504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  41 
 
 		 512 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.76 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  40.62 
 
 		 500 aa  326  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  38.01 
 
 		 519 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.44 
 
 		 503 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  41.08 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  41.1 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1361  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.4 
 
 		 505 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.09 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  42.64 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  42.51 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  38.6 
 
 		 506 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  37.53 
 
 		 504 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  41.2 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  37.32 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  41.4 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  38.33 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.21 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  38.33 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  38.33 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  36.36 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.33 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  38.12 
 
 		 506 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>