46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0648 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  53.91 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  53.65 
 
 		 260 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  50.19 
 
 		 268 aa  258  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  53.22 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  51.97 
 
 		 260 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  41.48 
 
 		 277 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  31.9 
 
 		 345 aa  68.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  24.86 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  26.74 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  24.89 
 
 		 383 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 		 1321 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  26.35 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.65 
 
 		 912 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.4 
 
 		 884 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.21 
 
 		 883 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  28.29 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  23.89 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  24.5 
 
 		 566 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  27.64 
 
 		 435 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 642 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  25.73 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 641 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  28.31 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  24.68 
 
 		 376 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 		 328 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  26.36 
 
 		 364 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.17 
 
 		 569 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  25.42 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  26.6 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  24.81 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 907 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  28.79 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.512731 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  25.46 
 
 		 405 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 608 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  30.05 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  25.31 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 1332 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  21.94 
 
 		 389 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  25.37 
 
 		 413 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>