More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1493 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  41.38 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  34.44 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  33.99 
 
 		 246 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  37.59 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  31.91 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  32.62 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  30.41 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  32.03 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  32 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  32.88 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  31.47 
 
 		 428 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  33.11 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  33.11 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  30.41 
 
 		 256 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  32.17 
 
 		 409 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  32.17 
 
 		 409 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  32.17 
 
 		 409 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  32.26 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  34.27 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  30.41 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  31.25 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  30.41 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  30.77 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  35.04 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  35.77 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  33.33 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  31.72 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  31.47 
 
 		 441 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  32.06 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  32.39 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  31.47 
 
 		 406 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  33.33 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  33.33 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  32.45 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  32.37 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  29.73 
 
 		 256 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  31.47 
 
 		 408 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  32.19 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  31.94 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  31.08 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  29.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  29.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  29.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  29.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  33.08 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  29.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  33.1 
 
 		 228 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  32.12 
 
 		 239 aa  77  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  31.91 
 
 		 237 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  35.46 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  30.82 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  32.39 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  32.17 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  30.72 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  29.14 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  31.82 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  30.92 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  31.94 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  32.87 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  28.48 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  31.69 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  33.33 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  31.47 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1014  ribonuclease III  31.08 
 
 		 425 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  35.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  30.99 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1010  ribonuclease III  31.08 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  30.56 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  30.72 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  26.32 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  30.28 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  34.59 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  30.07 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  34.59 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  31.39 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1243  ribonuclease III  32.64 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000271922  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  27.7 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>