184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1932 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  712    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  80.69 
 
 
349 aa  597  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  72.7 
 
 
345 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  71.35 
 
 
350 aa  497  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  70.77 
 
 
350 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  69.45 
 
 
350 aa  490  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  66.67 
 
 
348 aa  488  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  66.67 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  67.62 
 
 
350 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  62.03 
 
 
347 aa  434  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  62.72 
 
 
349 aa  433  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  63.58 
 
 
349 aa  424  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  63.87 
 
 
349 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  63.87 
 
 
349 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  55.33 
 
 
350 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  55.23 
 
 
349 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  55.59 
 
 
349 aa  386  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  53.31 
 
 
350 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  54.47 
 
 
351 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  50 
 
 
349 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  53.2 
 
 
348 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  54.36 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  54.36 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  49.71 
 
 
346 aa  339  5e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.86 
 
 
350 aa  333  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  47.99 
 
 
348 aa  322  7e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
913 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  28.71 
 
 
485 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  26.39 
 
 
490 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3069  hypothetical protein  28.3 
 
 
502 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  26.4 
 
 
481 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  26.56 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  26.56 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2917  hypothetical protein  27.59 
 
 
495 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.381583  normal  0.0360554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.99 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.96 
 
 
388 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.96 
 
 
388 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  26.55 
 
 
397 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  26.18 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  26.28 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.26 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  24.31 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.62 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  25.15 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  26.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  22.99 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  26.37 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.35 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.25 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  23.6 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.82 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.7 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000174189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.71 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  24.21 
 
 
473 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1856  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  23.78 
 
 
484 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0653145  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.42 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0682  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.91 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.14 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0646  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.81 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1585  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.46 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421947  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.92 
 
 
445 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.96 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  25.65 
 
 
447 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  24.11 
 
 
407 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2502  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.33 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0775365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  21.88 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0448  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.86 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.74 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.34 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  21.65 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1593  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  20.95 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0016  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.05 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.33 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  21.6 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0890  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.05 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  21.65 
 
 
385 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.1 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2505  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.38 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000055762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.47 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.25 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000934298  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  19.35 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.99 
 
 
328 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2141  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.63 
 
 
335 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.76 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.103952  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.46 
 
 
316 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.46 
 
 
316 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.46 
 
 
316 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.15 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01095  hypothetical protein  22.61 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000485703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  19.82 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.61 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.16382e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>