More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1556 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  100 
 
 
232 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  46.48 
 
 
220 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  41.51 
 
 
213 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  38.32 
 
 
214 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  36.82 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  37.81 
 
 
456 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  36.32 
 
 
456 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  32.59 
 
 
221 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.73 
 
 
222 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.28 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.54 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.81 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.7 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  33.51 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.65 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  31.4 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.1 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.27 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.05 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  33.7 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.63 
 
 
188 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.38 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1197  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.15 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  0.148864 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  29.79 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
229 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 
238 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.09 
 
 
233 aa  92  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.04 
 
 
233 aa  92  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
217 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  32.2 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  31.58 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
396 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  32 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.99 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  32.28 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.74 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.16 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
209 aa  89  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.07 
 
 
202 aa  89  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  29.84 
 
 
188 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.88 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.42 
 
 
188 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.93 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.42 
 
 
188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.42 
 
 
188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  30.73 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  29.81 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
187 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.02 
 
 
202 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  35.94 
 
 
219 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.99 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  31.15 
 
 
269 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  31.15 
 
 
188 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  29.86 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  32.45 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  32.09 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.44 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.17 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  31.77 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  29.3 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.46 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  30.11 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  30.77 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.47 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.6 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  26.74 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  29.57 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  30.6 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  28.14 
 
 
236 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.42 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  33.71 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.21 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>