More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1052 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1021    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  54.55 
 
 
494 aa  547  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  51.12 
 
 
490 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.02 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  44.42 
 
 
486 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  43.06 
 
 
497 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  41.16 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  42.68 
 
 
492 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  41.14 
 
 
494 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  40.08 
 
 
496 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  40.68 
 
 
532 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  40.08 
 
 
496 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  39.51 
 
 
535 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  39.92 
 
 
497 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  40.4 
 
 
544 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  40.4 
 
 
496 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.63 
 
 
501 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  38.79 
 
 
497 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  38.62 
 
 
549 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  40 
 
 
496 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  39.43 
 
 
497 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  38.38 
 
 
497 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  39.92 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  37.78 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.64 
 
 
534 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.88 
 
 
497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  39.24 
 
 
493 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  39.8 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  38.28 
 
 
494 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39 
 
 
504 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  38.37 
 
 
490 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  39.23 
 
 
498 aa  346  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  38.71 
 
 
498 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  40.29 
 
 
521 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  38.33 
 
 
474 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  33.63 
 
 
549 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  37.58 
 
 
495 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.52 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.4 
 
 
492 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  34.21 
 
 
496 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  52 
 
 
578 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.34 
 
 
267 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.34 
 
 
267 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  50 
 
 
609 aa  240  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  53.15 
 
 
270 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  53.15 
 
 
270 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  53.15 
 
 
270 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  30.78 
 
 
556 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  53.15 
 
 
270 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  53.15 
 
 
270 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  52.7 
 
 
254 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  52.7 
 
 
254 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  52.97 
 
 
270 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  29.67 
 
 
551 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  49.78 
 
 
288 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  28.35 
 
 
556 aa  227  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  53.37 
 
 
270 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  47.44 
 
 
258 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  49.55 
 
 
259 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  52.02 
 
 
264 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  44.14 
 
 
308 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  46.29 
 
 
261 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  42.66 
 
 
320 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  43.12 
 
 
288 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  43.72 
 
 
279 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  49.47 
 
 
263 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  42.52 
 
 
309 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  43.32 
 
 
289 aa  181  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  40.45 
 
 
263 aa  181  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  41.13 
 
 
256 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  41.36 
 
 
318 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  40.4 
 
 
329 aa  180  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  40.65 
 
 
280 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  40.65 
 
 
280 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  41.7 
 
 
258 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  41.47 
 
 
375 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  42.06 
 
 
277 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  40.26 
 
 
279 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  41.94 
 
 
405 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  40.61 
 
 
365 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  40.33 
 
 
289 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  36.96 
 
 
337 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  39.45 
 
 
280 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  40.09 
 
 
293 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  40.81 
 
 
270 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  40.44 
 
 
280 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  40.72 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  41.1 
 
 
294 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  41.67 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  40.47 
 
 
280 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  39.73 
 
 
271 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  43.5 
 
 
258 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  37.21 
 
 
257 aa  174  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  39.65 
 
 
269 aa  173  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  41.59 
 
 
326 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  37.34 
 
 
310 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  41.74 
 
 
369 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  38.81 
 
 
359 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  41.2 
 
 
331 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  41.12 
 
 
357 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>