More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0919 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  75.1 
 
 
263 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  74.81 
 
 
263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  67.7 
 
 
279 aa  361  8e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  58.14 
 
 
263 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  54.41 
 
 
267 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  54 
 
 
261 aa  267  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 
265 aa  242  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  47.53 
 
 
264 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  46.77 
 
 
264 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  48.83 
 
 
264 aa  215  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  46.01 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  46.49 
 
 
242 aa  199  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 
260 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
266 aa  165  8e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
265 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.86 
 
 
257 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  39.52 
 
 
265 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
252 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
264 aa  150  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
262 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 
250 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.47 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.64 
 
 
264 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
253 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 
252 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
255 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
248 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 
256 aa  142  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.9 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  34.82 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 
252 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36.76 
 
 
258 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  36.03 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 
253 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
248 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 
249 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 
249 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  35.88 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  36.64 
 
 
258 aa  136  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
258 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  34.24 
 
 
258 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  36.61 
 
 
263 aa  135  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  36.95 
 
 
257 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 
253 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
249 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  36.11 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  35.46 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
251 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  35.27 
 
 
270 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 
256 aa  133  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  35.06 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
253 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  36.23 
 
 
272 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  36.47 
 
 
250 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  36.47 
 
 
250 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
253 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  36.69 
 
 
259 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  34.26 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  37.89 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  34.23 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  34.24 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
251 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
254 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  34.23 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>