More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0755 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  804    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  84.6 
 
 
410 aa  662    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  61.48 
 
 
396 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  48.69 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  41.69 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  41.79 
 
 
390 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  40.44 
 
 
397 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 
386 aa  263  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  37.3 
 
 
430 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  39.36 
 
 
402 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  40.25 
 
 
381 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  234  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  34.95 
 
 
399 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  33.74 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  34.47 
 
 
397 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  30.2 
 
 
367 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.5 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.38 
 
 
403 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.47 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.57 
 
 
401 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
401 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.72 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  27.76 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  26.91 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
413 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.96 
 
 
402 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
402 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  26.49 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.78 
 
 
391 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  26.59 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 
400 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 
405 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 
406 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.95 
 
 
443 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  25.55 
 
 
654 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  24.82 
 
 
644 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 
405 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.05 
 
 
407 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  26.89 
 
 
411 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 
405 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.25 
 
 
397 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
403 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.4 
 
 
411 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  27.01 
 
 
395 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  25.59 
 
 
397 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.83 
 
 
657 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 
406 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  25.37 
 
 
671 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.68 
 
 
410 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.87 
 
 
409 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.44 
 
 
410 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  29.07 
 
 
409 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  26.05 
 
 
395 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.94 
 
 
412 aa  103  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 
452 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.21 
 
 
410 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.72 
 
 
397 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  25.55 
 
 
397 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.95 
 
 
399 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2147  hypothetical protein  25.61 
 
 
419 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0010107  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  35 
 
 
443 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.61 
 
 
417 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  26.72 
 
 
397 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.07 
 
 
663 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  24.33 
 
 
643 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.25 
 
 
397 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
412 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.67 
 
 
397 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  23.91 
 
 
656 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  22.28 
 
 
696 aa  99.8  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.04 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.31 
 
 
409 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.25 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.88 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.75 
 
 
663 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  30.47 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  25.12 
 
 
652 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  26.12 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.53 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
402 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.29 
 
 
642 aa  96.7  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  25.55 
 
 
406 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  23.33 
 
 
657 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26 
 
 
651 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  25.66 
 
 
402 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  25.83 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  24.33 
 
 
654 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.01 
 
 
647 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.93 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  26.34 
 
 
409 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>