More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3621 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 
268 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.3 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.46 
 
 
269 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.84 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.78 
 
 
289 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1543  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.94 
 
 
248 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
251 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.47 
 
 
251 aa  158  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.69 
 
 
267 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
268 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3039  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.46 
 
 
267 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0932911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1147  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.25 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1169  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.55 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
253 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
253 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
253 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 
253 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 
253 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  42.48 
 
 
259 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 
253 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
262 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.36 
 
 
267 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2094  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.32 
 
 
255 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.2 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4050  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.56 
 
 
260 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1685  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.17 
 
 
250 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.159562  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.77 
 
 
266 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.33 
 
 
253 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.54 
 
 
259 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.62 
 
 
274 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.63 
 
 
270 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.11 
 
 
259 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
270 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.84 
 
 
266 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1396  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.35 
 
 
255 aa  142  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000419761  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
266 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.16 
 
 
269 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.26 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.55 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.35 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.82 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1431  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.66 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1359  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.73 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.04 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.35 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.29 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1115  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.05 
 
 
228 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.91 
 
 
263 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.77 
 
 
287 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.34 
 
 
267 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.56 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.64 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.6 
 
 
260 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.45 
 
 
265 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.56 
 
 
258 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.55 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.91 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.02 
 
 
268 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.04 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.95 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.76 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.07 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.09 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.63 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.48 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.9 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.89 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.87 
 
 
285 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.23 
 
 
270 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  37.18 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.29 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.55 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.5 
 
 
265 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.09 
 
 
265 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.25 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00560  anthranilate synthase, putative  40.72 
 
 
752 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
296 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0250  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.74 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.5 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.09 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.09 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.87 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.85 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.57 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.73 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.29 
 
 
264 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>