65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0419 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  37.2 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  40.97 
 
 
295 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  38.44 
 
 
302 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  38.78 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  36.81 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  35.36 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  34.56 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  37.36 
 
 
302 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  36.26 
 
 
313 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  34.86 
 
 
304 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  35.84 
 
 
290 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  35.29 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  35.47 
 
 
290 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  35.31 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  34.84 
 
 
290 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  37.22 
 
 
254 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  32.51 
 
 
298 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  31.93 
 
 
298 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  32.71 
 
 
282 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  31.99 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  32.17 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  31.72 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  31.27 
 
 
285 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  30.55 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  30.94 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  31.11 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  28.92 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  31.85 
 
 
290 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  30.69 
 
 
291 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  29.69 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  31.05 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  31.18 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  27.43 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  27.43 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  27.43 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  29.46 
 
 
276 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  30.35 
 
 
295 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  28.47 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  29.23 
 
 
295 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  28.21 
 
 
284 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2190  hypothetical protein  29.43 
 
 
297 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.315226  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  29.06 
 
 
302 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  26.6 
 
 
284 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  28.78 
 
 
286 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  29.74 
 
 
287 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  31.01 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  31.17 
 
 
287 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  30.38 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  28.74 
 
 
268 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  29.96 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  29.26 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  29.1 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  26.37 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  29.55 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  26.64 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  26.07 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  28.39 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.71 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.91 
 
 
339 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.8 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  35.56 
 
 
687 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  28.67 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>