More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3113 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1013    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 495 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.69 
 
 		 501 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.9 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.51 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  49.69 
 
 		 492 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  48.03 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.98 
 
 		 493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  48.07 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.55 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  45.92 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  45.92 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  46.73 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  47.24 
 
 		 496 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  45.92 
 
 		 497 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.4 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  46.42 
 
 		 544 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  45.7 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  44.08 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  44.94 
 
 		 494 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  43.72 
 
 		 498 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  43.84 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  41.18 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  41.38 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  41.38 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.33 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  41.72 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  39.32 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  38.61 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  41.72 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.3 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  39.48 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  37.75 
 
 		 549 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  38.37 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.2 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  37.1 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  38.79 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  34.36 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  35.55 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  34.38 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  56.14 
 
 		 288 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  32.14 
 
 		 556 aa  249  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  51.98 
 
 		 270 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  51.09 
 
 		 270 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.54 
 
 		 267 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.66 
 
 		 254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.66 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.66 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.66 
 
 		 254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.66 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  31.02 
 
 		 556 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.66 
 
 		 270 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.54 
 
 		 267 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  51.69 
 
 		 308 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.27 
 
 		 551 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  50.85 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  50 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  49.78 
 
 		 270 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  48.15 
 
 		 258 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  54.45 
 
 		 264 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  45.61 
 
 		 259 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  45.62 
 
 		 261 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  54.1 
 
 		 263 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  41.13 
 
 		 279 aa  202  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  43.26 
 
 		 258 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  38.67 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  36.36 
 
 		 276 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  37.17 
 
 		 367 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  38.14 
 
 		 292 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.32 
 
 		 365 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  38.53 
 
 		 269 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  35.29 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  36.53 
 
 		 262 aa  169  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  37.92 
 
 		 314 aa  169  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  38.89 
 
 		 288 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  37.33 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  39.07 
 
 		 256 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  35.96 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  36.49 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  36.82 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  166  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  32.22 
 
 		 301 aa  166  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  39.45 
 
 		 306 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  38.79 
 
 		 272 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  38.32 
 
 		 271 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  38.32 
 
 		 271 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  33.93 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  37.67 
 
 		 320 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  37.02 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  37.82 
 
 		 280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  37.82 
 
 		 280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  38.79 
 
 		 274 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  37.83 
 
 		 280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  36.44 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  36.61 
 
 		 316 aa  163  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  36.53 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.44 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  36.53 
 
 		 294 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  39.07 
 
 		 283 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>