183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02736 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  100 
 
 		 471 aa  956    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  68.12 
 
 		 471 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  47.22 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  46.65 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  48.15 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  47.24 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  46.49 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  46.79 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  47.95 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  45.97 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  45.51 
 
 		 468 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  45.73 
 
 		 468 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  44.4 
 
 		 472 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  44.33 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  47.02 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  46.36 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  46.8 
 
 		 468 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  46.99 
 
 		 468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  44.27 
 
 		 471 aa  346  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  46.1 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  47.48 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  43.31 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  47.3 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  36.19 
 
 		 525 aa  252  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.48 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  32.82 
 
 		 458 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  33.95 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  30.65 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  32.13 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  30.41 
 
 		 580 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  29.67 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  25.2 
 
 		 539 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  26.37 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.86 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.63 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.21 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  24.9 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  23.96 
 
 		 552 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  24.3 
 
 		 578 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.29 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  25.4 
 
 		 438 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29.49 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.22 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.61 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  23.16 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  26.38 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25.49 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.46 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32.17 
 
 		 677 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.24 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  32.66 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  32.66 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  32.66 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  32.66 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  32.66 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  31.66 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  31.05 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  31.05 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  31.05 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  31.05 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  31.05 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  23.71 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  30.07 
 
 		 483 aa  67  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  26.57 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  30.53 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  31.05 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  26.32 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  31.19 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  30.53 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  22.04 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.68 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  38.04 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  28.77 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.87 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.24 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  21.92 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  21.52 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  23.4 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  35.11 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  21.65 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  21.52 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  21.52 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  21.52 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  35 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  34.33 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  37.63 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  33.06 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  36.61 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  21.97 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  36.04 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  24.01 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  43.01 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  21.52 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  21.52 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  21.75 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  23.29 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  25.63 
 
 		 539 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  25.81 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  27.15 
 
 		 534 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  35.58 
 
 		 575 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>