116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6291 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  564  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  86.76 
 
 		 298 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  63.18 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  61.01 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.65 
 
 		 287 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.65 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  58.48 
 
 		 297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  60.65 
 
 		 295 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  61.73 
 
 		 295 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  61.73 
 
 		 295 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  61.73 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  60.65 
 
 		 287 aa  281  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  58.84 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  56.32 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  58.84 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.45 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.84 
 
 		 287 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  61.73 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  54.67 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  55.96 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  57.76 
 
 		 285 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  55.63 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  62.45 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.29 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  56.34 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  63.18 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  56.68 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  58.18 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  54.84 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  55.2 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  60.84 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  59.8 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.8 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  51.99 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  57.4 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.83 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.79 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  47.72 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  47.37 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  51.11 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  46.45 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  45.39 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  45.39 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  45.39 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  49.51 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  47.06 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  46.71 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  50.75 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  47.55 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  47.44 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  47.42 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  47.42 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  47.42 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  47.42 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  47.42 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  47.42 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  46.07 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  41.5 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  46.38 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  38.93 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  44.69 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.04 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  44.93 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.91 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  42.96 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.27 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  47.67 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.32 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  41.24 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  43.73 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  38.51 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.53 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.65 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  36.43 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  43.7 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.68 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.24 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.08 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.36 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  28.74 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.42 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  21.99 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.46 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>