More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4837 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4837  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  337  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  89.35 
 
 		 169 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  63.19 
 
 		 159 aa  200  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  62.58 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  62.58 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  53.76 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  53.38 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  52.32 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  49.02 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  49.33 
 
 		 156 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  53.85 
 
 		 156 aa  151  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  49.02 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  50.33 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  53.38 
 
 		 157 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  53.47 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  51.49 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  48.55 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  52.48 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  42.34 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  36.03 
 
 		 151 aa  95.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  37.96 
 
 		 139 aa  91.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  40.16 
 
 		 147 aa  88.2  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  38.35 
 
 		 139 aa  88.2  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  37.69 
 
 		 144 aa  87.8  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  38.52 
 
 		 140 aa  87.8  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  35 
 
 		 152 aa  87.8  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  87.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  37.19 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  34.42 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.61 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  33.56 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.21 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.03 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  33.12 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  32.35 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  28.95 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.62 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.84 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  36.43 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.89 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.62 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.5 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  29.8 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.29 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.88 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.76 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  35.46 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.17 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  32.64 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  31.08 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.77 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.85 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.55 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.44 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.06 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  32.09 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  37.96 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.45 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  34.91 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  31.87 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  38.06 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  35.38 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30.87 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30.22 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  33.96 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.33 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30.22 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.34 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.03 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  33.33 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.03 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.12 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  34.15 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  34.03 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.86 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  35.21 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  31.88 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  31.33 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.5 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.99 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32.62 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.61 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  34.29 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.17 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  34.04 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.17 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  35.33 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.26 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.75 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.05 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.05 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  29.94 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  30.23 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  29.41 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  32.62 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>