127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1824 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  64.04 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  52.51 
 
 		 315 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  52.51 
 
 		 315 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  48.2 
 
 		 334 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  45.45 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  43.92 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  43.34 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  37.46 
 
 		 597 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.05 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.07 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.14 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.65 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.75 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.42 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.96 
 
 		 287 aa  85.9  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.86 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.24 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  23.16 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.89 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  23.43 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.79 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  22.52 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.62 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  30.97 
 
 		 644 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 264 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  33.68 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  25.33 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  20.68 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.78 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.24 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  21.14 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 271 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.44 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.7 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  24.49 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.7 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.75 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.31 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>