More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1215 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 368 aa  739    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  66.08 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  51.19 
 
 		 347 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  48.21 
 
 		 350 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  47.92 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  45.13 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  47.32 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  47.37 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  48.83 
 
 		 352 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  45.48 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  47.16 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  43.99 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  45.51 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  42.23 
 
 		 353 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  43.66 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  42.77 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  37.57 
 
 		 357 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  40.97 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  33.59 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  29.92 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  32.48 
 
 		 374 aa  162  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.01 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  33.59 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.37 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.8 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.88 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.8 
 
 		 329 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.65 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.87 
 
 		 335 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.57 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  34.96 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.66 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  26.96 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.71 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.76 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.79 
 
 		 346 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.33 
 
 		 428 aa  99.4  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 1080 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  24.7 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  26.38 
 
 		 328 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.33 
 
 		 329 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>