More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0891 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  55.25 
 
 		 224 aa  243  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  55.5 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  55.5 
 
 		 227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  54.88 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  54.42 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  52.04 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  54.13 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  53.39 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.23 
 
 		 511 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.23 
 
 		 511 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  52.27 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  52.34 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.96 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  44.1 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  52.11 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  44.2 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.62 
 
 		 526 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  52.29 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  48.79 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.19 
 
 		 528 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.36 
 
 		 534 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.91 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.13 
 
 		 516 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  46.67 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.13 
 
 		 516 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.86 
 
 		 527 aa  191  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.12 
 
 		 539 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 		 480 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  47.69 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.27 
 
 		 529 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.63 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 		 488 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  47.2 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47 
 
 		 517 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  42.11 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.48 
 
 		 483 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6626  cytidylate kinase  45.15 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  46.04 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 514 aa  174  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  39.38 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 236 aa  171  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  44.93 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  39.05 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  40.74 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.2 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>