194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0113 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0113  alpha-glucosidase  100 
 
 		 1019 aa  2116    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.5746e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  30.68 
 
 		 1311 aa  491  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.92 
 
 		 1965 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  26.15 
 
 		 1108 aa  219  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  25.94 
 
 		 1119 aa  191  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  31.8 
 
 		 785 aa  138  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  24.63 
 
 		 779 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  32.09 
 
 		 752 aa  128  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.34 
 
 		 801 aa  125  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  30.41 
 
 		 828 aa  124  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.84 
 
 		 836 aa  124  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.93 
 
 		 776 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 777 aa  118  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.82 
 
 		 779 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  23.19 
 
 		 770 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.05 
 
 		 788 aa  115  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.18 
 
 		 803 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.44 
 
 		 779 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  29.01 
 
 		 791 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  29.24 
 
 		 791 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.59 
 
 		 787 aa  107  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.71 
 
 		 788 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  27.91 
 
 		 795 aa  106  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 795 aa  106  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.38 
 
 		 788 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  24.42 
 
 		 821 aa  106  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  29.24 
 
 		 789 aa  105  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 743 aa  105  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.24 
 
 		 791 aa  104  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.3 
 
 		 806 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.47 
 
 		 797 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.92 
 
 		 799 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  28.03 
 
 		 683 aa  99.8  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  30.58 
 
 		 790 aa  99.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  26.37 
 
 		 845 aa  100  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  31.86 
 
 		 685 aa  95.5  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  25.42 
 
 		 768 aa  95.5  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  28.77 
 
 		 687 aa  94.7  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.94 
 
 		 746 aa  94.7  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  27.76 
 
 		 791 aa  94  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  26.55 
 
 		 702 aa  92.8  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  24.12 
 
 		 825 aa  91.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 927 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  28.52 
 
 		 1207 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  32.99 
 
 		 765 aa  90.1  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.23 
 
 		 784 aa  90.1  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 944 aa  90.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.45 
 
 		 792 aa  89.4  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  26.95 
 
 		 816 aa  89.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  25.93 
 
 		 840 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  24.9 
 
 		 815 aa  89  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.65 
 
 		 1024 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  31.97 
 
 		 765 aa  88.2  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  28.63 
 
 		 798 aa  88.2  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  30.68 
 
 		 715 aa  87.8  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 806 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  29.9 
 
 		 760 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.27 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.38 
 
 		 836 aa  85.5  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  27.54 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  28.63 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  26.16 
 
 		 779 aa  84.7  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  28.69 
 
 		 661 aa  84  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  27.94 
 
 		 761 aa  84.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  33.16 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  27.34 
 
 		 1128 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  30.7 
 
 		 766 aa  83.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  24.44 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.36 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.97 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  25.81 
 
 		 973 aa  81.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  22.41 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  25.85 
 
 		 803 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 951 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  26.17 
 
 		 969 aa  80.1  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  32 
 
 		 804 aa  80.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  30.09 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  25.76 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  25.74 
 
 		 760 aa  79  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  26.6 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.98 
 
 		 798 aa  78.2  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  25.94 
 
 		 679 aa  77.8  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.74 
 
 		 749 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  25.52 
 
 		 679 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  25.94 
 
 		 679 aa  77.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 799 aa  77.4  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  29.74 
 
 		 839 aa  77  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  29.28 
 
 		 762 aa  77  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  22.01 
 
 		 715 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  29.8 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  22.3 
 
 		 777 aa  75.5  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  27.68 
 
 		 829 aa  74.3  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>