More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1942 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1942  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.111661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1846  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.02 
 
 
212 aa  149  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 
515 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.16 
 
 
515 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.92 
 
 
525 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0156  hypothetical protein  38.46 
 
 
210 aa  123  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 
532 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.09 
 
 
496 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.78 
 
 
530 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 
528 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.7 
 
 
519 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.38 
 
 
510 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 
490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.28 
 
 
521 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.56 
 
 
517 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.65 
 
 
514 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.53 
 
 
521 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  38.21 
 
 
466 aa  108  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 
514 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.88 
 
 
490 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  29.02 
 
 
524 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.02 
 
 
519 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.88 
 
 
521 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.74 
 
 
533 aa  104  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.18 
 
 
523 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
509 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.36 
 
 
500 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
504 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0539  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.36 
 
 
218 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.18 
 
 
511 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  34.29 
 
 
463 aa  102  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.14 
 
 
498 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 
510 aa  101  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.55 
 
 
520 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.85 
 
 
533 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.11 
 
 
530 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 
514 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 
524 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.81 
 
 
507 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 
524 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.61 
 
 
507 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  30.29 
 
 
500 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.8 
 
 
517 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.31 
 
 
507 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  31.55 
 
 
490 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.78 
 
 
468 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.27 
 
 
499 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.12 
 
 
508 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 
501 aa  96.3  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.55 
 
 
524 aa  96.3  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.72 
 
 
507 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.82 
 
 
500 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.1 
 
 
514 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.72 
 
 
533 aa  95.5  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.32 
 
 
492 aa  95.5  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.1 
 
 
501 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.64 
 
 
504 aa  95.1  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 
518 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.21 
 
 
504 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  30.15 
 
 
515 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
513 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.91 
 
 
499 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.92 
 
 
500 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.86 
 
 
542 aa  92  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.26 
 
 
513 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.84 
 
 
510 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  34.01 
 
 
496 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.98 
 
 
513 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.73 
 
 
524 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  35.56 
 
 
519 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  30.8 
 
 
523 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.03 
 
 
516 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
519 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.05 
 
 
524 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0857  hypothetical protein  29.07 
 
 
517 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.724628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.47 
 
 
538 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.37 
 
 
515 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0933  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.8 
 
 
517 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.57 
 
 
520 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.44 
 
 
498 aa  89.4  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13371  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  30.77 
 
 
524 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.45 
 
 
487 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.84 
 
 
510 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.84 
 
 
515 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17101  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  30.13 
 
 
563 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.343407  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.84 
 
 
510 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  29.61 
 
 
488 aa  89  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1688  YjeF-related protein  29.47 
 
 
461 aa  89  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  32.8 
 
 
514 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.84 
 
 
515 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.84 
 
 
515 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.84 
 
 
515 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  35.27 
 
 
499 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  32.28 
 
 
514 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.84 
 
 
515 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 
496 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.58 
 
 
524 aa  87.8  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>