More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0520 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  61.36 
 
 		 603 aa  788    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  65.82 
 
 		 607 aa  817    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  58.83 
 
 		 600 aa  725    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 599 aa  1238    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  50.85 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  49.49 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  48.47 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  48.81 
 
 		 594 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  47.79 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  46.68 
 
 		 593 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  46.68 
 
 		 593 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  48.22 
 
 		 595 aa  558  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  47.7 
 
 		 610 aa  548  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  47.36 
 
 		 593 aa  547  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  42.9 
 
 		 658 aa  511  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  43.13 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.27 
 
 		 607 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 624 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.07 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  37.22 
 
 		 641 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 628 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 593 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.01 
 
 		 653 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 		 625 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  37.42 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  38.38 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.87 
 
 		 665 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.58 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.41 
 
 		 610 aa  363  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 615 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.17 
 
 		 669 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 		 607 aa  360  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  37.01 
 
 		 616 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.84 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.14 
 
 		 607 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.26 
 
 		 622 aa  355  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.25 
 
 		 685 aa  355  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  36.79 
 
 		 615 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  35.2 
 
 		 609 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.1 
 
 		 614 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 		 616 aa  349  9e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 619 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  35.31 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 612 aa  346  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  34.36 
 
 		 609 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  35.16 
 
 		 619 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  35.64 
 
 		 610 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  34.53 
 
 		 609 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 		 629 aa  342  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  34.55 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  35.22 
 
 		 627 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.19 
 
 		 604 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.43 
 
 		 677 aa  339  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  35.89 
 
 		 631 aa  339  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  35.11 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  36.09 
 
 		 601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  35.33 
 
 		 609 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  35.4 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 666 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  35.46 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 		 610 aa  333  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  35.46 
 
 		 610 aa  333  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 617 aa  332  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  33.89 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 610 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  35.27 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  34.38 
 
 		 644 aa  332  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  35.43 
 
 		 617 aa  331  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.88 
 
 		 613 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 609 aa  331  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.12 
 
 		 614 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  33.85 
 
 		 656 aa  330  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  31.66 
 
 		 675 aa  330  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 609 aa  330  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  33.85 
 
 		 639 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 609 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  33.84 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>