250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0136 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0136  ABC-type amino acid transport systems, periplasmic component  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0671  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 
274 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03610  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  27.72 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.04 
 
 
280 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0339  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.21 
 
 
282 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.35 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0333  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.36 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0209533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.59 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  29.69 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1642  ABC transporter, substrate-binding protein  24.25 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.275268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6090  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  23.75 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.13 
 
 
502 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.13 
 
 
502 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  26.34 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0369  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  23.58 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  27.2 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0240  extracellular solute-binding protein family 3  25.1 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.8 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.35 
 
 
259 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
259 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.44 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.8 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.8 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.8 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0246  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
253 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  21.77 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.44 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  24.24 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.8 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0156  extracellular solute-binding protein  20.29 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.16 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  25.93 
 
 
250 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.36 
 
 
503 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  25.63 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.08 
 
 
483 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  23.97 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00441  ABC amino acid transporter periplasmic component  25.51 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.71 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  22.14 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.71 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.71 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  23.94 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
262 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  23.67 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.3 
 
 
489 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.71 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  25.3 
 
 
489 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  21.99 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.3 
 
 
489 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.45 
 
 
265 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
266 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
266 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 
246 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
280 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.64 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  22.89 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.21 
 
 
503 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  21.37 
 
 
271 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  24.18 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  24.18 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 
267 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.19 
 
 
266 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.69 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  24.18 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0415  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  25.72 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  22.81 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  23.81 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.38 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  27.09 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  22.44 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  25 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  24.07 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  22.05 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  25.31 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.29 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>