More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1410 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  37.16 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  34.05 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  35.67 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  35.64 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 285 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.12 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.12 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.12 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.12 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  32.31 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 303 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 299 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  32.37 
 
 		 298 aa  95.5  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  35.86 
 
 		 293 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  29.29 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  29.29 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  35.86 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 911 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 		 282 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 864 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 550 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 871 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  34.81 
 
 		 599 aa  85.5  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 822 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 822 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 822 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 528 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 528 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 308 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  29.21 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 858 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  28.99 
 
 		 884 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 801 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  35.26 
 
 		 766 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  34.53 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 889 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 837 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  28.65 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 821 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 768 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  34.46 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0964  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  36.64 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 767 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  30.11 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 836 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 772 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  30.51 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  29.17 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 787 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 787 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 388 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  31.03 
 
 		 455 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 538 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 787 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  39.25 
 
 		 879 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 674 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  33.76 
 
 		 735 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  35.25 
 
 		 735 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 838 aa  72.4  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 701 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>