More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1351 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1351  permease  100 
 
 		 390 aa  770    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  44.9 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  39.23 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  40.47 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  38.98 
 
 		 382 aa  260  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  31.3 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  31.62 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  31.62 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  35.07 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  34.49 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  34.22 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  34.22 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  34.79 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  34.79 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  34.79 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  34.79 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  34.22 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  34.67 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  33.43 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  33.43 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  33.43 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  33.43 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  33.43 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  33.53 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  33.53 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  33.53 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  33.53 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  31.75 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  32.05 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  32.63 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  30.03 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  33.96 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  31.46 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  30.25 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  29.48 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  32.77 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  32.77 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.68 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.68 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.62 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.78 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  28.34 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  31.81 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.86 
 
 		 363 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.98 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.3 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.33 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.35 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  30.43 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.49 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  26.1 
 
 		 352 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  30.13 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  26.13 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.88 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  28.02 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.63 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  27.69 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.83 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.45 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.28 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  25.23 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  27.81 
 
 		 665 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.93 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  28.53 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.21 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.39 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.59 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.91 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  27.16 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  29.32 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.66 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  26.43 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.67 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.18 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  26.91 
 
 		 382 aa  120  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.33 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  26.46 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.88 
 
 		 435 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.73 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.73 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.73 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.73 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.73 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>