65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  266  8.999999999999999e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.97 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  35.61 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4367  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128291 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.46 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 158 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.54 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  38.36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.64 
 
 		 238 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1817  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 133 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>