More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
327 aa  620  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  50.15 
 
 
314 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  48.48 
 
 
332 aa  218  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  46.31 
 
 
330 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  45.54 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  47.55 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  47.27 
 
 
372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  44.75 
 
 
316 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  44.38 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  48.48 
 
 
327 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  39.69 
 
 
370 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  45.18 
 
 
344 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  48.49 
 
 
346 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  43.47 
 
 
375 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  45.32 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  44.79 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  41.4 
 
 
355 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  43.81 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  44.25 
 
 
329 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  45.42 
 
 
341 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  47.51 
 
 
294 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  40.95 
 
 
361 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  45.56 
 
 
335 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  45.09 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  44.14 
 
 
317 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  43.25 
 
 
321 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 
328 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  38.61 
 
 
305 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  41.91 
 
 
320 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  44.17 
 
 
333 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  41.72 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  43.73 
 
 
317 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  43.89 
 
 
318 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  43.89 
 
 
318 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  43.89 
 
 
318 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  34.81 
 
 
339 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  39.37 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  34.91 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.65 
 
 
334 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 
318 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  27.99 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  31 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.29 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 
350 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  30.39 
 
 
355 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 
344 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 
329 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.28 
 
 
338 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 
348 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.91 
 
 
363 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  31.81 
 
 
356 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 
327 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  28.93 
 
 
355 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  28.67 
 
 
352 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  33.06 
 
 
318 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 
318 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  26.96 
 
 
346 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  33.12 
 
 
333 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  33.08 
 
 
340 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 
323 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.03 
 
 
335 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  33.06 
 
 
318 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 
323 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.68 
 
 
324 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  29.25 
 
 
346 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  28.8 
 
 
341 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.12 
 
 
318 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  31.47 
 
 
328 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.78 
 
 
346 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.89 
 
 
343 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.15 
 
 
337 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.69 
 
 
323 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  30 
 
 
327 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.96 
 
 
332 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  32.45 
 
 
339 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  29.78 
 
 
365 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  39.32 
 
 
325 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.37 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  27.49 
 
 
339 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08710  thiamine-monophosphate kinase  34.92 
 
 
382 aa  99.8  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.827789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  28.28 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  27.57 
 
 
320 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.42 
 
 
539 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  29.91 
 
 
354 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  25.57 
 
 
315 aa  99  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  27.57 
 
 
320 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  30.09 
 
 
329 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  30.09 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  31.63 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  30.68 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.13 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  33.43 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  30.09 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.29 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00281  putative thiamine-monophosphate kinase  32.78 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  28.53 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>