More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07890  dihydroorotate oxidase A  100 
 
 		 385 aa  739    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.57 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.18 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.58 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.44 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41.13 
 
 		 339 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.55 
 
 		 348 aa  269  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.27 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.43 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.6 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.01 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  44.86 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.37 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.77 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.96 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.04 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  39.72 
 
 		 377 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.56 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  43.77 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.8 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 345 aa  242  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 345 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 345 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 345 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 345 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 342 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.52 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.8 
 
 		 345 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.45 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.54 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.57 
 
 		 350 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  45.01 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.57 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.16 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.77 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  42.78 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.06 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.03 
 
 		 340 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.29 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 		 333 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  39.38 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  41.26 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.66 
 
 		 339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  41.38 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.87 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.03 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  40.11 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  44.54 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.58 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  42 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.74 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.74 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.09 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.59 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  44.99 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.95 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.16 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.77 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.31 
 
 		 336 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.23 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.35 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.57 
 
 		 337 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  43.68 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.64 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  43.75 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.13 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  43.75 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.72 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  42.98 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 		 339 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.61 
 
 		 378 aa  229  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.29 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.6 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.42 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  42.12 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>