67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  100 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  27.64 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.52 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.15 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.52 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.12 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  24.8 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.54 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.79 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  28.91 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  24.34 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.4 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.11 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  27.23 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  23.56 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  33.77 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.7 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2078  hypothetical protein  26.7 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  25.81 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  25.34 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.25 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.25 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.25 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.25 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  28.25 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.25 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.25 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.25 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.9 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.87 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.87 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  23.98 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  26.26 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.4 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.4 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.39 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.6 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.64 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  25.43 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  27.68 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  27.14 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  28.75 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  26.75 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.68 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.27 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.89 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.38 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  26.05 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>