More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4392 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4392  helicase domain protein  100 
 
 		 1069 aa  2164    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0282  Type III restriction enzyme, res subunit  28.04 
 
 		 1101 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.395373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2642  type III restriction enzyme, res subunit  29.12 
 
 		 1044 aa  279  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2946  SNF2 family protein  25.32 
 
 		 1024 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 		 964 aa  112  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.02 
 
 		 1212 aa  109  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  24.44 
 
 		 1095 aa  108  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 1172 aa  107  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 		 1170 aa  105  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1167 aa  104  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.78 
 
 		 941 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  24.72 
 
 		 801 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  30.72 
 
 		 942 aa  99.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  24.67 
 
 		 1057 aa  98.6  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.92 
 
 		 1170 aa  98.2  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  36.31 
 
 		 555 aa  98.2  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.34 
 
 		 1167 aa  95.9  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  24.01 
 
 		 963 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  23.34 
 
 		 925 aa  94.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  34.95 
 
 		 941 aa  92.8  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  38.55 
 
 		 572 aa  92.8  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  34.95 
 
 		 941 aa  92.8  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  26.2 
 
 		 1170 aa  92  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  34.12 
 
 		 554 aa  90.9  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  31.98 
 
 		 967 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  29.87 
 
 		 948 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  29.56 
 
 		 948 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  30.33 
 
 		 874 aa  88.6  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  29.54 
 
 		 948 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  33.93 
 
 		 560 aa  88.2  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  33.18 
 
 		 949 aa  88.6  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  32.79 
 
 		 968 aa  87.8  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  29.87 
 
 		 948 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  31.98 
 
 		 968 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  31.98 
 
 		 968 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  29.64 
 
 		 943 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  31.98 
 
 		 968 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  31.15 
 
 		 967 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  33.19 
 
 		 968 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  34.52 
 
 		 560 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  31.98 
 
 		 968 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  32.08 
 
 		 960 aa  87  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  28.95 
 
 		 948 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  34.38 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  24.26 
 
 		 1138 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  33.19 
 
 		 968 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  33.19 
 
 		 968 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  35.29 
 
 		 967 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  25.44 
 
 		 1145 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  33.19 
 
 		 968 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  29.09 
 
 		 982 aa  85.9  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  35.39 
 
 		 578 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  31.19 
 
 		 964 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  34.78 
 
 		 805 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0237  SNF2-related protein  38.79 
 
 		 990 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 919 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 968 aa  85.1  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.45 
 
 		 961 aa  84.7  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  29.96 
 
 		 960 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 		 905 aa  84.7  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  33.65 
 
 		 967 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  32.13 
 
 		 955 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 1116 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  29.09 
 
 		 1028 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 923 aa  84.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  27.66 
 
 		 892 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  37.1 
 
 		 916 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  37.1 
 
 		 915 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  33.68 
 
 		 975 aa  84  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.12 
 
 		 829 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  37.84 
 
 		 921 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  33.2 
 
 		 933 aa  83.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  31.74 
 
 		 951 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  37.1 
 
 		 915 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  30.68 
 
 		 980 aa  82.8  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  32.98 
 
 		 1168 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  31.19 
 
 		 947 aa  82.8  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  30.29 
 
 		 966 aa  82.4  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  34.03 
 
 		 898 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.72 
 
 		 933 aa  82.8  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  29.71 
 
 		 898 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27 
 
 		 1129 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  30.96 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  34.43 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>