185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4245 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  100 
 
 
167 aa  330  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  59.32 
 
 
125 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  57.63 
 
 
135 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  57.14 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  50.37 
 
 
139 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  51.24 
 
 
137 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  51.28 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  59.05 
 
 
128 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  47.71 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  55.56 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  50 
 
 
145 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  50 
 
 
132 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  57.26 
 
 
140 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  44.2 
 
 
178 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  46.28 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  43.41 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  42.75 
 
 
178 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  42.19 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  44.8 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  41.3 
 
 
194 aa  94  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  47.75 
 
 
122 aa  93.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  41.3 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  42.4 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  42.4 
 
 
192 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  41.94 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  49.46 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  49.46 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  39.37 
 
 
173 aa  87  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  47.2 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  49.46 
 
 
171 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  40.8 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  40.8 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.06 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  40.46 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  40.46 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  39.71 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  34.72 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  37.23 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  39.69 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  38.6 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  37.72 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  39.13 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  36.64 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  38.33 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  29.17 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  36.59 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  41.38 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  38.2 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  38.2 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  34.81 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  38.04 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  32.62 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  32.62 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  38.79 
 
 
203 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  41.67 
 
 
1097 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  28 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  38.6 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.59 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  34.21 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  38.6 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  38.6 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  41.3 
 
 
395 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  31.09 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  27.13 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  33.04 
 
 
197 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  32.26 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  39.76 
 
 
1099 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  32.09 
 
 
870 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  37.74 
 
 
222 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  38 
 
 
442 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  39.76 
 
 
1101 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  33.04 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  36.26 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  36.56 
 
 
254 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  33.04 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  41.1 
 
 
490 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3905  Ankyrin  41.67 
 
 
1112 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
258 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  30.51 
 
 
293 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  30.77 
 
 
382 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  32.35 
 
 
891 aa  51.6  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  32.35 
 
 
483 aa  51.2  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  42.42 
 
 
811 aa  51.2  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  38.37 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  35.16 
 
 
855 aa  50.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  40.58 
 
 
347 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  33.33 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  42.35 
 
 
494 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0198  ankyrin  40.79 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43531  predicted protein  38.81 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181933  normal  0.18997 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  36.99 
 
 
737 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  32.32 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  35.06 
 
 
186 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  33.96 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  27.19 
 
 
253 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36555  predicted protein  31.46 
 
 
192 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>