More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4051 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  60.18 
 
 
362 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  56.12 
 
 
343 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  55.89 
 
 
342 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  52.23 
 
 
367 aa  345  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  51.98 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  54.27 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  51.67 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  46.95 
 
 
335 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  46.18 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  42.73 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  43.6 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  41.82 
 
 
336 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  43.5 
 
 
336 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  43.5 
 
 
336 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  42.12 
 
 
337 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  40.3 
 
 
337 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  41.3 
 
 
338 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  42.6 
 
 
336 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  44.63 
 
 
337 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  44.41 
 
 
337 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  43.75 
 
 
337 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.75 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  43.75 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  44.08 
 
 
337 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.42 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  42.76 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  36.97 
 
 
336 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  43.71 
 
 
334 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  43.4 
 
 
341 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  43.61 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  39.33 
 
 
337 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  41.28 
 
 
360 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  40.46 
 
 
347 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
335 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  34.03 
 
 
331 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  34.95 
 
 
329 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.78 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  35.84 
 
 
328 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  34.81 
 
 
330 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  31.18 
 
 
344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
334 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  29.24 
 
 
342 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  32 
 
 
329 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.25 
 
 
345 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
336 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  31.66 
 
 
345 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  31.66 
 
 
345 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  31.66 
 
 
345 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  31.66 
 
 
345 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  31.66 
 
 
345 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  32.74 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.08 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
326 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.14 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  32.44 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  32.19 
 
 
317 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  32.53 
 
 
327 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
337 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
328 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.34 
 
 
334 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  32.36 
 
 
342 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
328 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  31.34 
 
 
389 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  31.36 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.21 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.83 
 
 
330 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  34.63 
 
 
323 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  32.73 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  25.66 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.39 
 
 
341 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 
365 aa  113  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.39 
 
 
341 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 
330 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  30.75 
 
 
331 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  28.92 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 
330 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 
342 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.31 
 
 
338 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.08 
 
 
335 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  33.43 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.81 
 
 
347 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 
344 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>