215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1949 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  53.17 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  46.74 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  46.07 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  42.03 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  45.91 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.53 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.77 
 
 		 289 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  38.93 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  37.91 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  39.93 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  38.06 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  39.42 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  39.64 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  39.38 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 276 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  39.16 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  39.19 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  38.66 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.15 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  34.91 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  34.75 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  33.98 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  37.09 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  36.94 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 273 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  34.75 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.49 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  39.64 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  34.07 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  37.4 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  38.91 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.19 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  36.62 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  36.88 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  38.06 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  35.18 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  35.04 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 342 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  33.09 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  35.36 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  36.53 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1997  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  35.04 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  37.09 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.12 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  36.88 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  34.63 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  37.98 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  38.85 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  27.86 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  40.08 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  36.74 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  32.31 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  34.09 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  33.1 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  32.07 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  37.4 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  34.38 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3438  putative transcriptional regulator, XRE family  35.02 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00198305  normal  0.0571393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  40.67 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>