More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1210 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  100 
 
 		 615 aa  1231    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.96 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  52.48 
 
 		 593 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 595 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  47.11 
 
 		 614 aa  538  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 616 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 615 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.92 
 
 		 618 aa  527  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  47.45 
 
 		 600 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  49.06 
 
 		 590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  48.29 
 
 		 609 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  46.39 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  46.17 
 
 		 593 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  45.48 
 
 		 602 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  44.73 
 
 		 620 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.14 
 
 		 626 aa  485  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  48.01 
 
 		 581 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  45.95 
 
 		 589 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 609 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  45.41 
 
 		 588 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.29 
 
 		 1257 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  38.32 
 
 		 984 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 636 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  30.14 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  31.12 
 
 		 605 aa  276  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  29.96 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  29.96 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 614 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  31.39 
 
 		 619 aa  273  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.1 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  34.75 
 
 		 619 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 1218 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 		 606 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  32.37 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 596 aa  264  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  32.52 
 
 		 567 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.34 
 
 		 567 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  31.62 
 
 		 568 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.64 
 
 		 669 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  30.11 
 
 		 604 aa  261  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  33.77 
 
 		 672 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  29.04 
 
 		 608 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  33.66 
 
 		 601 aa  260  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.97 
 
 		 587 aa  259  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  34.75 
 
 		 1436 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  31.98 
 
 		 576 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  30.09 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.41 
 
 		 608 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.99 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.78 
 
 		 640 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.82 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  31.35 
 
 		 615 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.02 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.02 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.02 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  34.06 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  34.18 
 
 		 666 aa  257  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.75 
 
 		 589 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.47 
 
 		 634 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  28.64 
 
 		 618 aa  256  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  31.03 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.87 
 
 		 567 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  28.99 
 
 		 636 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  29.57 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  32.68 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.71 
 
 		 652 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  34.15 
 
 		 665 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  29.73 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33.73 
 
 		 601 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  34.76 
 
 		 631 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.73 
 
 		 601 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  31.16 
 
 		 625 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  31.11 
 
 		 663 aa  253  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  31.84 
 
 		 672 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  27.51 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  32.8 
 
 		 695 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.82 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  31.23 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  32.83 
 
 		 1321 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  34.55 
 
 		 631 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  34.55 
 
 		 631 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.68 
 
 		 595 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.23 
 
 		 609 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  33.4 
 
 		 634 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 1332 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  32.01 
 
 		 733 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  31.76 
 
 		 764 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.41 
 
 		 571 aa  250  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  33.51 
 
 		 603 aa  250  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.24 
 
 		 615 aa  249  9e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.06 
 
 		 591 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.95 
 
 		 617 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  32.93 
 
 		 619 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  33.07 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>