More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1149 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  339  9e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.51 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  40.91 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 150 aa  97.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  41.13 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  37.76 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  41.13 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  41.13 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  44.44 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  51 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 153 aa  90.9  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  35.92 
 
 		 167 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0865  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  36.09 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.09 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.09 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 144 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.87 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.18 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  40.3 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 146 aa  88.2  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  36.03 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 147 aa  87.8  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 152 aa  87.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 152 aa  87.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.04 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 150 aa  87.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  47.87 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  39.5 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0896  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  44.62 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  37.4 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.45 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>