More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2614 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
238 aa  494  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  64.66 
 
 
278 aa  315  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  57.73 
 
 
239 aa  267  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  53.42 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  53.33 
 
 
249 aa  248  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  50.87 
 
 
238 aa  247  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  30.08 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  38.36 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  31.8 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  36.25 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  36.98 
 
 
257 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  37.63 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  46.53 
 
 
505 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  35.57 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  36.69 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  36.81 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  39.71 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3511  glutamine amidotransferase class-I  34.39 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175158  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  36.77 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  40.16 
 
 
522 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  34.07 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  31.03 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  35.34 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  28.57 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  29.61 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.64 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  30.06 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  30.9 
 
 
521 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  31.49 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  30.41 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  34.76 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  45.83 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  28.85 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  32.73 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  30.46 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  32.91 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  32.91 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  28.7 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.05 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  38.69 
 
 
540 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  30.33 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  26.61 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  30.41 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  30.46 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.88 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  28.81 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  37.76 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  38.41 
 
 
505 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  34.2 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  28.12 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  34.46 
 
 
532 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  32.28 
 
 
513 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  33.12 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  37.23 
 
 
538 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  43.3 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  32.58 
 
 
513 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  33.85 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  33.85 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  37.23 
 
 
538 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  36.57 
 
 
511 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  30.35 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  28.8 
 
 
548 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  30.56 
 
 
533 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  31.21 
 
 
510 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  32.95 
 
 
506 aa  75.5  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  29.78 
 
 
540 aa  75.5  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  38.69 
 
 
539 aa  75.5  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  32.81 
 
 
512 aa  75.1  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  30.57 
 
 
511 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  27.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  40.82 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  34.48 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  28.77 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  26.42 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.08 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  34.44 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  29.73 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  26.07 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  28.98 
 
 
575 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  33.08 
 
 
514 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  33.33 
 
 
516 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  30.68 
 
 
507 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>