111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1588 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  779    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.1 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.76 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.79 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  26.62 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.42 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  27.42 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.42 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.42 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  27.09 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.09 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  27.09 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24.81 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.86 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.08 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.08 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.08 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.08 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.08 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  27.46 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.18 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  24.48 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  30.23 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  23.68 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  24.01 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  19.1 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.18 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.74 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.93 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  25.88 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.3 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  26.32 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.26 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.88 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  19.94 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  25.88 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.88 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  21.85 
 
 		 957 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  25.88 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  24.54 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.57 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  23.05 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  21.51 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  22.34 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.41 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  27.63 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  21.53 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  29.11 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.85 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  21.95 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  26.09 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  26.09 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  26.09 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>