201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0856 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0856  Patatin  100 
 
 
321 aa  658    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  58.81 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  45.17 
 
 
349 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  45.34 
 
 
321 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  42.28 
 
 
442 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  36.92 
 
 
354 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  39.76 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  36.84 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  36.68 
 
 
356 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  35.18 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  34.46 
 
 
349 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  34.46 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  34.76 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  34.01 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  34.56 
 
 
346 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  33.85 
 
 
353 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  33.85 
 
 
349 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  31.53 
 
 
349 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  34.24 
 
 
343 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  31.52 
 
 
346 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  33.33 
 
 
444 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  33.43 
 
 
343 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  33.75 
 
 
382 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  32.52 
 
 
345 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  30.7 
 
 
405 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  34.26 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  33.76 
 
 
386 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  31.4 
 
 
359 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  33.85 
 
 
375 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  33.23 
 
 
346 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  32.06 
 
 
365 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  30.43 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  32.56 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 
433 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  30.24 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  32 
 
 
350 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  30.43 
 
 
382 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  32.75 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  32.44 
 
 
375 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  32.1 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  29.85 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  30.99 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  32.21 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  30 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  31.17 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  29.31 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  30.75 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  32.04 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  31.42 
 
 
341 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  29.88 
 
 
414 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  28.78 
 
 
357 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  29.59 
 
 
414 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  27.33 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  28.13 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  28.13 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  28.66 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  28.57 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  28.7 
 
 
370 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  30.06 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  30.65 
 
 
470 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  28.21 
 
 
351 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  29.72 
 
 
346 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  28.25 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  30.15 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.22 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  29.46 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  26.55 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  27.3 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  28.04 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  26.84 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  25.88 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  25.88 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  24.52 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.94 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  24.52 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.94 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.94 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.94 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.94 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.94 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.08 
 
 
763 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.94 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  27.01 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  27.01 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  28.41 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  28.69 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  28.29 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  27.73 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.5 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  29.52 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  25.21 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  26.58 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  25.83 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  27.54 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.15 
 
 
777 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  25.45 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  25.44 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  24.07 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  24.32 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>