More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2084 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  68.93 
 
 
786 aa  1053    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  52.49 
 
 
820 aa  728    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  62.2 
 
 
745 aa  885    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  56.56 
 
 
764 aa  800    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  100 
 
 
770 aa  1535    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  37.05 
 
 
792 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  36.1 
 
 
716 aa  340  8e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  44.09 
 
 
473 aa  333  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  30.27 
 
 
753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 
740 aa  319  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  45.18 
 
 
475 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  44.67 
 
 
479 aa  304  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 
725 aa  294  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 
773 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  36.83 
 
 
465 aa  262  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  42.6 
 
 
732 aa  261  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 
641 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  48.1 
 
 
625 aa  249  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  44.64 
 
 
604 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 
796 aa  191  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  32.22 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 
476 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 
495 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 
476 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 
494 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 
812 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  30.04 
 
 
476 aa  168  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  31.74 
 
 
538 aa  164  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 
506 aa  164  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  31.96 
 
 
500 aa  163  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 
495 aa  163  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
456 aa  161  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.29 
 
 
465 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 
500 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 
518 aa  157  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 
463 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.41 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 
471 aa  156  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  30.86 
 
 
474 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 
439 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 
471 aa  154  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 
423 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
495 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 
465 aa  152  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.74 
 
 
471 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 
494 aa  151  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.52 
 
 
471 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.52 
 
 
471 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.52 
 
 
471 aa  150  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.52 
 
 
471 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.52 
 
 
471 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.52 
 
 
471 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
469 aa  150  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 
496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.91 
 
 
489 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  26.65 
 
 
503 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  28.26 
 
 
462 aa  149  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  28.54 
 
 
463 aa  148  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 
486 aa  147  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  30.12 
 
 
488 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.74 
 
 
471 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 
485 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 
520 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  28.31 
 
 
463 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  30.19 
 
 
485 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.03 
 
 
460 aa  146  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 
496 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
468 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
468 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 
481 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 
468 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.74 
 
 
471 aa  144  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.07 
 
 
467 aa  144  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 
463 aa  143  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.5 
 
 
468 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 
466 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 
436 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.67 
 
 
486 aa  141  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  141  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.67 
 
 
486 aa  141  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 
482 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.07 
 
 
467 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 
466 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.07 
 
 
471 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.07 
 
 
471 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  27.86 
 
 
467 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.84 
 
 
467 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.84 
 
 
467 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  28.07 
 
 
467 aa  140  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>