More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1446 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  89.44 
 
 
142 aa  260  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  77.46 
 
 
142 aa  226  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  74.65 
 
 
142 aa  220  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  69.72 
 
 
142 aa  207  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  39.55 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
143 aa  110  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
140 aa  104  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
140 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
140 aa  95.9  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.38 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  31.15 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.87 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  33.88 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  34.88 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  30.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.79 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  30 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  30.16 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  30 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.15 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
240 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  30.13 
 
 
171 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  30.13 
 
 
171 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 
171 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 
171 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.33 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  27.2 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.2 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.15 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.16 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.87 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.33 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.33 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.33 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>