More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0719 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  70.06 
 
 
489 aa  696    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  100 
 
 
491 aa  985    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2676  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  86.07 
 
 
491 aa  829    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  69.48 
 
 
489 aa  654    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  69.04 
 
 
500 aa  677    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  53.86 
 
 
490 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 
483 aa  511  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.1 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1831  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  51.04 
 
 
484 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221701  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1287  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  50.52 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000579108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  47.15 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.12 
 
 
481 aa  422  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  46.39 
 
 
482 aa  411  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 
652 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  44.59 
 
 
649 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  44.81 
 
 
649 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.89 
 
 
649 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  42.07 
 
 
649 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  43.55 
 
 
606 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  43.59 
 
 
543 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.4 
 
 
498 aa  277  4e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  36.98 
 
 
507 aa  269  8e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1251  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.05 
 
 
503 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.39 
 
 
495 aa  257  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.56 
 
 
494 aa  252  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.07 
 
 
494 aa  250  4e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.26 
 
 
495 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35 
 
 
522 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  28.83 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.82 
 
 
367 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.68 
 
 
370 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.98 
 
 
375 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.94 
 
 
372 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.86 
 
 
373 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.49 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.98 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.01 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.89 
 
 
369 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.1 
 
 
370 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.53 
 
 
369 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.8 
 
 
368 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.45 
 
 
370 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.76 
 
 
377 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.25 
 
 
395 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.88 
 
 
376 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.08 
 
 
381 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.7 
 
 
376 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.21 
 
 
371 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.21 
 
 
371 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0508  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.4 
 
 
388 aa  103  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.84 
 
 
371 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
379 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 
379 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.95 
 
 
381 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.18 
 
 
369 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.53 
 
 
384 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.95 
 
 
381 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.08 
 
 
382 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.11 
 
 
384 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.68 
 
 
376 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.98 
 
 
379 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.43 
 
 
385 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 
371 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.99 
 
 
374 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.26 
 
 
377 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.91 
 
 
369 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.47 
 
 
373 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
377 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.94 
 
 
379 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
377 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.87 
 
 
369 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.25 
 
 
368 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1410  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.73 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2833  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.26 
 
 
372 aa  100  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.45 
 
 
373 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.37 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  27.59 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.39 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.39 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.39 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.85 
 
 
372 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.39 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.02 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  26.44 
 
 
382 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.05 
 
 
372 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.57 
 
 
365 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.25 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.49 
 
 
357 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.88 
 
 
387 aa  98.2  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.86 
 
 
367 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.47 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.48 
 
 
373 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2337  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.65 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00144843  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.4 
 
 
397 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.56 
 
 
382 aa  97.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.3 
 
 
374 aa  97.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  27.97 
 
 
615 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.02 
 
 
379 aa  97.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.6 
 
 
379 aa  96.7  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>