More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06930 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 728 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  48.21 
 
 		 754 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  49.36 
 
 		 736 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  49.2 
 
 		 736 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  53.69 
 
 		 740 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  53.25 
 
 		 645 aa  690    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  51.4 
 
 		 727 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 728 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.12 
 
 		 741 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  53.25 
 
 		 645 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  53.08 
 
 		 645 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  52.92 
 
 		 637 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  50.8 
 
 		 728 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 741 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  51.4 
 
 		 727 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 		 749 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  47.74 
 
 		 755 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  49.28 
 
 		 748 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  52.09 
 
 		 740 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  49.44 
 
 		 716 aa  643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.92 
 
 		 730 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  52.48 
 
 		 764 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.88 
 
 		 736 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  55.14 
 
 		 749 aa  726    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  49.36 
 
 		 743 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  51.13 
 
 		 728 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.89 
 
 		 784 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  47.43 
 
 		 764 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  48.83 
 
 		 765 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  50.64 
 
 		 638 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  52.17 
 
 		 726 aa  675    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  53.25 
 
 		 645 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  48.68 
 
 		 754 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  53.31 
 
 		 774 aa  728    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  51.85 
 
 		 746 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.3 
 
 		 737 aa  816    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  52.16 
 
 		 642 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  53.22 
 
 		 740 aa  716    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 728 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.03 
 
 		 728 aa  739    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  52.76 
 
 		 645 aa  687    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.94 
 
 		 728 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.33 
 
 		 735 aa  678    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.04 
 
 		 1217 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  53.25 
 
 		 645 aa  688    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  51.52 
 
 		 625 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  52.66 
 
 		 729 aa  692    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  48.06 
 
 		 755 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  52.64 
 
 		 763 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  52.59 
 
 		 725 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  52.44 
 
 		 645 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.73 
 
 		 760 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  48.54 
 
 		 754 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  49.12 
 
 		 716 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 728 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  48.99 
 
 		 756 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  49 
 
 		 759 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  52.71 
 
 		 782 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.75 
 
 		 732 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  53.13 
 
 		 722 aa  722    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.03 
 
 		 739 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 		 754 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  51.4 
 
 		 727 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  52.58 
 
 		 738 aa  698    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.23 
 
 		 638 aa  854    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  51.59 
 
 		 659 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  54.04 
 
 		 674 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  50.95 
 
 		 659 aa  673    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.4 
 
 		 807 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  51.09 
 
 		 776 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.88 
 
 		 736 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.5 
 
 		 770 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  50.96 
 
 		 695 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.11 
 
 		 631 aa  698    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 728 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.36 
 
 		 626 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  51.29 
 
 		 728 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  50.88 
 
 		 634 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 712 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  51.84 
 
 		 642 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  55.23 
 
 		 723 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  50.72 
 
 		 728 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.4 
 
 		 785 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 727 aa  640    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  47.5 
 
 		 731 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.92 
 
 		 841 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  53.41 
 
 		 645 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 728 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.22 
 
 		 631 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.55 
 
 		 659 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  49.61 
 
 		 677 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>