More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6888 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  100 
 
 		 875 aa  1734    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  58.41 
 
 		 735 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  57.69 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  57.88 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  57.88 
 
 		 713 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  30.96 
 
 		 317 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 253 aa  125  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 488 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 488 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 488 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  42.15 
 
 		 462 aa  103  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  43.09 
 
 		 312 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 407 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 465 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 238 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  41.48 
 
 		 247 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 376 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 292 aa  100  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  42.96 
 
 		 236 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  40.65 
 
 		 248 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  43.31 
 
 		 239 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 437 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  43.31 
 
 		 239 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  43.31 
 
 		 239 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 305 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 259 aa  99  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 271 aa  98.6  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  39.84 
 
 		 248 aa  98.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 231 aa  98.2  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  39.02 
 
 		 248 aa  97.8  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.68 
 
 		 480 aa  97.8  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 248 aa  97.8  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 271 aa  97.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  36.29 
 
 		 170 aa  97.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  34.03 
 
 		 234 aa  97.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 443 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 248 aa  96.3  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 253 aa  96.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  39.69 
 
 		 1355 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 230 aa  96.3  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.87 
 
 		 305 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 243 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 437 aa  95.9  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 243 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 231 aa  95.9  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  35.94 
 
 		 248 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  35.16 
 
 		 248 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 349 aa  95.5  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.88 
 
 		 454 aa  95.5  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 239 aa  95.5  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  37.91 
 
 		 251 aa  95.1  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 308 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  41.38 
 
 		 309 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 336 aa  95.1  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 306 aa  94.7  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 223 aa  94.7  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 225 aa  94.7  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 248 aa  94.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 268 aa  94.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 243 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.82 
 
 		 322 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 229 aa  94.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 269 aa  94.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 386 aa  94  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.72 
 
 		 310 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 235 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 247 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.37 
 
 		 236 aa  94  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 231 aa  93.2  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  43.56 
 
 		 1298 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 270 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 253 aa  93.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  41.04 
 
 		 1376 aa  93.2  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  93.2  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  33.58 
 
 		 228 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 309 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 305 aa  93.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 		 356 aa  93.2  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 236 aa  92.8  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  36.36 
 
 		 254 aa  92.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 470 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 309 aa  92.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  36 
 
 		 235 aa  92.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 225 aa  92.8  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 243 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 123 aa  92.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 245 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  92  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  26.54 
 
 		 652 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 235 aa  92  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 242 aa  92  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 227 aa  92  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>