More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6615 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 320 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  42.99 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  39.49 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  39.49 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  39.49 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  39.49 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  39.49 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 		 315 aa  243  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  39.68 
 
 		 317 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.77 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  39.17 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  38.85 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  40.76 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 		 315 aa  232  8.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  40.45 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  35.6 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  37.74 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  39.03 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  36.79 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  28.96 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.58 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  30.58 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  30.58 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.317394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  31.69 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  30.59 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.44 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.81 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  28.11 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.44 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.96 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.88 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 335 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  31.22 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.82 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  35.59 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.84 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>