More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3170 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  55.38 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  51.6 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  52.4 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2743  dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 267 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.939063  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  40.24 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  39.2 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  42.74 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  38.25 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  40.69 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  37.15 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  42.08 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  35.43 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  32.28 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  35.43 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  36.88 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  39.54 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  38.25 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  38.17 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  38.55 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  38.64 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  31.64 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  36.82 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  42.08 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  37.26 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  33.73 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  40.39 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  40.39 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  37.26 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  34.52 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  38.55 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  40.7 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  39.36 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  45.03 
 
 		 267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  37.21 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  36.78 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  37.16 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  35.11 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  36.88 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  39.44 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  34.46 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  35.63 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>