More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2270 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
354 aa  719    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.69 
 
 
355 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.67 
 
 
356 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.54 
 
 
365 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.47 
 
 
356 aa  360  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  35.18 
 
 
356 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.79 
 
 
368 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
358 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
348 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
370 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.98 
 
 
370 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
348 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 
360 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  29.5 
 
 
349 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
366 aa  123  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  27.99 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.36 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.82 
 
 
343 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
336 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.16 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0369  alcohol dehydrogenase  25.83 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.07 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1949  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0237239  hitchhiker  9.46914e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.35 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  25.34 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.78 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.18 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  26.07 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.61 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.46 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.78 
 
 
345 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.33 
 
 
344 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  29.14 
 
 
342 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.84 
 
 
344 aa  59.3  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.67 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  26.16 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3023  L-threonine 3-dehydrogenase  26.22 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473403  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  26.52 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.16 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.16 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  26.16 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.43 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.43 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  28.04 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.45 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.6 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.79 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  26.16 
 
 
288 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.63 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2314  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.82 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  24.84 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  26.16 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.92 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.01 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.01 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.01 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  27.2 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.01 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.01 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.01 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  26.81 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  27.53 
 
 
342 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.38 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7063  L-threonine 3-dehydrogenase  26.35 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.01 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  23.37 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  25.26 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  27.14 
 
 
344 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  28.19 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.67 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.32 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.33 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>