180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2279 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  54.84 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  54.48 
 
 		 283 aa  302  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  53.68 
 
 		 288 aa  285  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.4 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  35.56 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.85 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  33.19 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  33.33 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  30.87 
 
 		 351 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.52 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.35 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.89 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  31.03 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  31.69 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  30.52 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  32.41 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.63 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.22 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.46 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  25.91 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.98 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  24.43 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  27.43 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.98 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.98 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.23 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.34 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  26.32 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  25.8 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.67 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.67 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.13 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.79 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.67 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.67 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  22.42 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.67 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  30.43 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.74 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.67 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  25.98 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.93 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  23.62 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  25 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  24.32 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  22.83 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  26.25 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  24.85 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  25.2 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  23.21 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.56 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  25.17 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  26.5 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  23.26 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  25.09 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  27.44 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  24.5 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  22.85 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  31.15 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.05 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.7 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  27 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  25.9 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  25.9 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  33.33 
 
 		 505 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  24.64 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.55 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.42 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  25.6 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.19 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  26.05 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.42 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  24.64 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.48 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.48 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.42 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  24.28 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.17 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  27.92 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.23 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.23 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  25.39 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.23 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.23 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  23.42 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.27 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  27.83 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  22.46 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.23 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  26.67 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.06 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  24.02 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  25 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  28.94 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  25.4 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  24.15 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.18 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>