151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0159 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  338  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  70.19 
 
 
161 aa  259  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  57.86 
 
 
167 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  55.97 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  55.35 
 
 
161 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  54.72 
 
 
161 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  54.09 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  55.97 
 
 
163 aa  194  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  55.97 
 
 
163 aa  194  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  55.97 
 
 
163 aa  194  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  55.35 
 
 
163 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  55.35 
 
 
163 aa  192  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  55.35 
 
 
163 aa  192  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  57.86 
 
 
163 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  34.81 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  37.58 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  34.18 
 
 
161 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0829  hypothetical protein  36.25 
 
 
166 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  36.14 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  36.14 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  36.14 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  36.14 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  33.73 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  33.73 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  35.54 
 
 
172 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  33.13 
 
 
171 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  31.93 
 
 
171 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  33.13 
 
 
171 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  32.53 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.94 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  32.53 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  31.65 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  29.94 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  30.54 
 
 
172 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  31.14 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  31.14 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.54 
 
 
172 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.54 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.34 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.34 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.14 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.94 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  30.12 
 
 
172 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  30.12 
 
 
172 aa  90.9  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.31 
 
 
172 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.94 
 
 
172 aa  90.5  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.34 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  31.29 
 
 
171 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  26.19 
 
 
172 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  26.19 
 
 
172 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  26.19 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.71 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  30.18 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  29.76 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  34.09 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  28.48 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  25.88 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  32.37 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  32.37 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  32.37 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  31.58 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  27.56 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  30.08 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.43 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  29.2 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.65 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  30.94 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  30.94 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  30.94 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  30.94 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.94 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.94 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.94 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  26.95 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7365  Hcp1 family type VI secretion system effector  25 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.75 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  27.86 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  27.61 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  23.91 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  23.91 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  29.57 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.93 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.61 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  23.29 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0535  hypothetical protein  22.67 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2125  hcp protein  22.67 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2027  hcp protein  22.67 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>