More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3148 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3148  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  289  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1833  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 391 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1271  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0205  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 764 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 663 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1609  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1710  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 816 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  33.33 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 392 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 623 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 657 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 844 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 844 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.14 
 
 		 458 aa  60.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 353 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 887 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 668 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.17 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 544 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  32.77 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 657 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1185 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.25 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.73 
 
 		 718 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  31.3 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.3 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  35 
 
 		 1214 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1661  response regulator receiver  27.56 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.725823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.45 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  30.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1082  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.58 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  31.3 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 361 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  30.4 
 
 		 958 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0055  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  hitchhiker  0.000805427 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  30.36 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 526 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  25.93 
 
 		 191 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 785 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  30.83 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.38 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.67 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2848  nitrogen regulation protein NtrX, putative  33.62 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 664 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  31.09 
 
 		 248 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 776 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2833  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1222 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  33.02 
 
 		 734 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.5 
 
 		 2468 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>