More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2008 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.68 
 
 
6889 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.91 
 
 
1656 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.57 
 
 
3099 aa  847    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  28.51 
 
 
4165 aa  946    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  31.64 
 
 
3718 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.42 
 
 
2762 aa  873    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
4101 aa  8265    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.32 
 
 
1559 aa  634  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  31.38 
 
 
1559 aa  633  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 
3702 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 
3693 aa  622  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 
3693 aa  622  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
2103 aa  613  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.73 
 
 
3676 aa  613  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
2551 aa  607  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.29 
 
 
3696 aa  598  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 
1955 aa  600  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  32.42 
 
 
3130 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.42 
 
 
1587 aa  593  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  33.31 
 
 
4268 aa  590  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  32.48 
 
 
3427 aa  586  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.99 
 
 
3679 aa  586  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.38 
 
 
3092 aa  581  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.75 
 
 
4478 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
1874 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  32.26 
 
 
3089 aa  574  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.36 
 
 
1087 aa  574  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  40.6 
 
 
2498 aa  565  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  30.47 
 
 
2273 aa  563  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
2551 aa  560  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.32 
 
 
2880 aa  560  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 
1909 aa  556  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  31.29 
 
 
4646 aa  554  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  27.62 
 
 
2176 aa  554  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  39.75 
 
 
2943 aa  553  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  41.87 
 
 
3424 aa  553  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  29.49 
 
 
1577 aa  550  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  24.29 
 
 
2316 aa  550  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 
4647 aa  550  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.68 
 
 
1349 aa  549  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 
1354 aa  551  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  31.92 
 
 
2376 aa  550  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
2374 aa  549  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  30.45 
 
 
3093 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 
1646 aa  548  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  31.26 
 
 
2081 aa  546  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  37.67 
 
 
2462 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
5154 aa  547  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.57 
 
 
1349 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.95 
 
 
1337 aa  543  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  25.94 
 
 
3695 aa  542  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  38.68 
 
 
1402 aa  543  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  35.61 
 
 
1408 aa  540  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.42 
 
 
1939 aa  536  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  31.81 
 
 
3449 aa  537  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.01 
 
 
1372 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 
1424 aa  533  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 
1474 aa  532  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  31.85 
 
 
3033 aa  530  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 
2477 aa  529  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  30.97 
 
 
2454 aa  526  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.43 
 
 
2230 aa  522  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  31.11 
 
 
1537 aa  524  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.26 
 
 
1101 aa  523  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  36.82 
 
 
1144 aa  520  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  30.46 
 
 
3281 aa  519  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  40.38 
 
 
2604 aa  518  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
1574 aa  514  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 
7279 aa  514  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  30.15 
 
 
3108 aa  514  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.45 
 
 
2890 aa  514  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  37.98 
 
 
4080 aa  513  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 
2333 aa  513  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.55 
 
 
4151 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  35.61 
 
 
3090 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.29 
 
 
2136 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  38.34 
 
 
3099 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
1816 aa  507  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  37.87 
 
 
2113 aa  506  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  36.24 
 
 
3252 aa  506  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  38.31 
 
 
1602 aa  506  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.86 
 
 
1909 aa  506  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  32.92 
 
 
3335 aa  506  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.61 
 
 
1822 aa  506  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  39.29 
 
 
1466 aa  503  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.24 
 
 
2232 aa  504  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.35 
 
 
1581 aa  504  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 
1653 aa  503  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  32.81 
 
 
4186 aa  500  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  39.01 
 
 
1911 aa  499  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 
7110 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.5 
 
 
1804 aa  499  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  31.61 
 
 
2727 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  38 
 
 
2684 aa  497  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  36.92 
 
 
1302 aa  498  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.91 
 
 
3176 aa  498  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
5400 aa  497  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 
1470 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.02 
 
 
1867 aa  492  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  37.68 
 
 
2126 aa  493  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>