59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0380 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
125 aa  242  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  52.42 
 
 
130 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  52.85 
 
 
123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  33.61 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  31.15 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  32.76 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  31.9 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  30.08 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  27.87 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  29.51 
 
 
293 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  28.69 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  24.17 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  27.1 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  28.97 
 
 
115 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  27.27 
 
 
277 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  30.59 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  29.35 
 
 
115 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  27.72 
 
 
148 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  24.32 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  30.86 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  24.77 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  24.79 
 
 
230 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  26.92 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  23.85 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  29.13 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  27.56 
 
 
140 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  22.64 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  26.92 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1005  roadblock/LC7 family protein  28.32 
 
 
223 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0861653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  28.23 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  25.69 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  25 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  28.23 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  26.77 
 
 
147 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  28.3 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  29.2 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 
138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 
137 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  27.36 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  27.08 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  24.51 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  26.42 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  27.05 
 
 
139 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  21.28 
 
 
125 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 
135 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  27.38 
 
 
140 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  26.26 
 
 
118 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>